Analyse de la performance des dosages commerciaux développés en laboratoire

Mark Espy, MS

Selon les données présentées à la Conférence Interscience sur les agents antimicrobiens et la chimiothérapie (ICAAC) 2014, quatre dosages différents pour la détection du norovirus dans les échantillons de selles se sont déroulés de manière comparable. Des chercheurs de la Mayo Clinic ont comparé les performances d’une réaction en chaîne par polymérase en temps réel (PCR [LDT]) et de trois tests moléculaires commerciaux (Luminex GPP [Waltham, MA], BioFire FilmArray [Salt Lake City, Utah] et Focus Simplexa [Cypress, CA]). Chaque méthode a été utilisée pour tester 169 échantillons de selles pour norovirus, dont les résultats ont été comparés à un «résultat consensuel» obtenu à partir d’au moins trois des quatre tests de PCR évalués.

Mark Espy, MS, division de la microbiologie clinique, Mayo Clinic, a déclaré à Healio.com/Gastroenterology: «Trois d’entre eux ont une bonne spécificité: le FilmArray, le Focus [Simplexa] et le« home brew assay »[LDT] que nous avons. Lorsque nous avons d’abord testé les échantillons avec la Luminex, la spécificité était très mauvaise; il y avait beaucoup de positifs norovirus qui n’ont été confirmés par aucun autre test. Lorsque nous avons réexécuté les échantillons avec le nouveau lot de réactifs, la spécificité était comparable à ce que nous avons observé avec les autres tests. « 

Simplexa et LDT ont montré une sensibilité de 100% contre 96% pour BioFire et 94% pour Luminex bactériologique.

Accoriding à Espy, « Ils ont tous une bonne sensibilité, et probablement une bonne spécificité, mais nous sommes un peu préoccupés par le Luminex. Ce que nous allons faire à l’hôpital dans l’avenir, ce sont des tests sur place, et comme nous n’en avons pas beaucoup, nous allons utiliser le BioFire FilmArray. Il est très facile à mettre en place, il fait de multiples cibles – près de 20. Le seul inconvénient est qu’il est limité à un spécimen à la fois, mais nous n’en voyons pas beaucoup en interne, donc ça va bien marcher pour nous. «